Vědci popsali rysy „jihoafrického“ kmene koronaviru

Dokazuje to studie mezinárodního týmu vědců, publikovaná 9. března v časopise Nature.

Práci provedli vědci z Brazílie, Velké Británie, Německa a Spojených států pod vedením Tulia de Oliveira z University of KwaZulu-Natal v Durbanu. Výzkumníci došli k závěru, že 501Y.V2 pochází z Eastern Cape a k jeho výskytu dochází v srpnu 2020.

Oblast Nelson Mandela Bay je považována za zónu výskytu nového typu koronaviru, po kterém se kmen rychle rozšířil ve třech provinciích – Eastern Cape, Western Cape a KwaZulu-Natal, přičemž vytlačil další varianty SARS-CoV -2.

Koronavirus zabíjí: hvězdy, které zemřely na pandemii,

Ve studii autoři analyzovali 2 882 kompletních genomů SARS-CoV-2 shromážděných organizací South African Genomic Surveillance Network (NGS-SA) mezi 5. březnem a 10. prosincem 2020. Na základě získaných dat vědci dospěli k závěru, že druhá vlna epidemie COVID-19 v Jižní Africe, která začala kolem října 2020 a byla obzvláště intenzivní, byla z velké části způsobena aktivním šířením kmene 501Y.V2.

Tato hypotéza byla potvrzena objevem osmi mutací v spike proteinu jihoafrické variety, který je zodpovědný za průnik viru do buňky. Jedna z těchto mutací byla také nalezena v britském kmeni B.1.1.7. Bylo prokázáno, že je zodpovědný za zvýšenou vazbu na lidský ACE2 receptor, na který se SARS-CoV-2 váže na buněčném povrchu.

Další mutace, E484K, činí kmen odolnějším vůči neutralizačním protilátkám. Vědci poznamenávají, že tato vlastnost jihoafrického kmene může vést ke snížení účinnosti vakcín proti COVID-19, které se zaměřují na spike protein.

Autoři objasňují, že účinek mutací nebyl dosud plně prostudován a vyžaduje další analýzu.